手记

生信分析画图QplotApp设计

数据导入方式

1.Excel数据粘贴到文本框(主要)
2.tsv或csv文件上传(对于大文件)
数据导入主要居于粘贴的方法,Excel是每台电脑的必备软件,并有计算筛选功能,
用户可以很方便的修改名称,筛选数据,然后粘贴在网页上。

分组文件

常规分析中,经常需要对样本进行分组,分组方式有可能是多样的,有的可能是按性别、年龄;有时样本的分类信息未知或样本比较离散,就需要去除这些样本。Qplot设计时为了不反复的导入数据,需要导入多种分组的分组表格。下面是分组文件的准备方式。

ID名称分组1分组2分组x
A1A1
A2A1A
A3A3
A4A1A
A5A

B1B

B2B2B
B3B3
B4B2B
B5B2

格式如上,第一列是ID名(通常是样本名),后面列是不同的分组信息,
不同的分组之间没有关系,可以根据自己需求添加很多列,
如:分组1这一列表示,A1-A5样本属于A组,B1-B5样本属于B组。
注意:分组名留空表示以这种分组分析时,丢弃这个样本,如分组2列,丢弃A5 B1,然后其它样本分为3组分析。

  • 修改标题等的字体。

  • 多种配色,常见杂志的配色(使用 ggsci 等),ggsci配色参考

  • 多种样式,提供多种ggplot themes。

  • 多格式下载,以ggplot2画图提供常见格式下载,pdf svg png jpg tiff

image.png

页面排版

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作者:quan575
链接:https://www.jianshu.com/p/a1ee5110a378


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