浏览器搜索与 Bio.entrez 搜索结果不同

Question

当我使用 Bio Entrez 进行搜索时，我得到了不同的结果。例如，当我使用查询“covid sideeffect”在浏览器上搜索时，我得到 344 个结果，而当我使用 Bio Entrez 时，我只得到 92 个结果。这是我正在使用的代码。

from Bio import Entrez

Entrez.email = "[e-mail]"

handle = Entrez.esearch(db="pubmed", retmax=40, term="covid side effect", idtype="acc")

record = Entrez.read(handle)

handle.close()

print(record['Count'])

我希望有人可以帮助我解决这个差异。

Answer 1

由于某种原因，无论是 R api 还是 Python API，每个人似乎都有相同的问题。我找到了一种解决方法来获得相同的结果。它很慢，但它可以完成工作。如果你的结果小于 10k，你可以使用 Selenium 来获取 pubmedid。否则，我们可以使用下面的代码来抓取数据。我希望这对将来的人有帮助。import requests# # Custom Date Range# req = requests.get("https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=covid&filter=dates.2009/01/01-2020/03/01&format=pmid&sort=pubdate&size=200&page={}".format(i))# # Custom Year Range# req = requests.get("https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=covid&filter=years.2010-2019&format=pmid&sort=pubdate&size=200&page={}".format(i))# #Relative Date # req = requests.get("https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=covid&filter=datesearch.y_1&format=pmid&sort=pubdate&size=200&page={}".format(i))# # filter language # # &filter=lang.english# # filter human # #&filter=hum_ani.humans# Systematic Review#&filter=pubt.systematicreview# Case Reports # &filter=pubt.casereports# Age# &filter=age.newbornsearch = "covid lungs"# search_list = "+".join(search.split(' '))def id_retriever(search_string):    string = "+".join(search_string.split(' '))    result = []    old_result = len(result)    for page in range(1,10000000):        req = requests.get("https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term={string}&format=pmid&sort=pubdate&size=200&page={page}".format(page=page,string=string))        for j in req.iter_lines():            decoded = j.decode("utf-8").strip(" ")            length = len(decoded)            if "log_displayeduids" in decoded and length > 46:                data = (str(j).split('"')[-2].split(","))                result = result + data                data = []        new_result = len(result)        if new_result != old_result:            old_result = new_result        else:            break    return resultids=id_retriever(search)len(ids)