使用 Dask 按部分高效读取大型 csv 文件

现在,我正在使用Dask读取大型csv文件,并对其进行一些后处理(例如,进行一些数学运算,然后通过一些ML模型进行预测并将结果写入数据库)。避免加载内存中的所有数据,我想按当前大小的块读取:读取第一个块,预测,写入,读取第二个块等。


我尝试了下一个解决方案,使用和:skiprowsnrows


import dask.dataframe as dd

read_path = "medium.csv"


# Read by chunk

skiprows = 100000

nrows = 50000

res_df = dd.read_csv(read_path, skiprows=skiprows)

res_df = res_df.head(nrows)


print(res_df.shape)

print(res_df.head())

但是我得到错误:


值错误:样本不够大,无法包含至少一行数据。请在调用中增加字节数sampleread_csv/read_table


另外,据我所知,它将每次([False,False,...,True,...])计算二进制掩码,以查找要加载的行的所有数据。我们怎样才能更有效率地做到这一点?也许使用dask中的一些分布式或延迟函数?


幕布斯7119047
浏览 182回答 1
1回答

红颜莎娜

Dask数据帧将为您对数据进行分区,您无需使用nrows/skip_rowsdf = dd.read_csv(filename)如果你想挑选一个特定的分区,那么你可以使用分区访问器part = df.partitions[i]但是,您可能还希望并行应用函数。df.map_partitions(process).to_csv("data.*.csv")
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