使用 TukeyHSD 进行多重比较时出现类型错误

Question

我正在尝试从 statsmodels 应用 TukeyHSD，但收到以下错误消息。

---------------------------------------------------------------------------

TypeError                                 Traceback (most recent call last)

<ipython-input-68-503f7cac5cbb> in <module>()

      1 from statsmodels.stats.multicomp import pairwise_tukeyhsd

      2 

----> 3 pairwise_tukeyhsd(endog=data['value'], groups=data['sample_id'])

c:\users\hambarsous\appdata\local\programs\python\python36\lib\site-packages\statsmodels\stats\multicomp.py in pairwise_tukeyhsd(endog, groups, alpha)

     36     '''

     37 

---> 38     return MultiComparison(endog, groups).tukeyhsd(alpha=alpha)

c:\users\hambarsous\appdata\local\programs\python\python36\lib\site-packages\statsmodels\sandbox\stats\multicomp.py in __init__(self, data, groups, group_order)

    794         if group_order is None:

    795             self.groupsunique, self.groupintlab = np.unique(groups,

--> 796                                                             return_inverse=True)

    797         else:

    798             #check if group_order has any names not in groups

c:\users\hambarsous\appdata\local\programs\python\python36\lib\site-packages\numpy\lib\arraysetops.py in unique(ar, return_index, return_inverse, return_counts, axis)

    221     ar = np.asanyarray(ar)

    222     if axis is None:

--> 223         return _unique1d(ar, return_index, return_inverse, return_counts)

    224     if not (-ar.ndim <= axis < ar.ndim):

    225         raise ValueError('Invalid axis kwarg specified for unique')

c:\users\hambarsous\appdata\local\programs\python\python36\lib\site-packages\numpy\lib\arraysetops.py in _unique1d(ar, return_index, return_inverse, return_counts)

    278 

    279     if optional_indices:

--> 280         perm = ar.argsort(kind='mergesort' if return_index else 'quicksort')

    281         aux = ar[perm]

    282     else:

TypeError: '<' not supported between instances of 'str' and 'int'

Answer 1

对我的问题的评论使我走上了进一步检查 data['sample_id'] 列的元素的道路。似乎这就是问题所在，因为它是数字或字母/数字的混合体，我相信只有数字的条目会导致错误。我只是在有数字的元素中添加了一些字母，然后代码就运行了。