当已经使用了除非 KeyError 时引发 KeyError

Question

我在使用 Python 程序 Cupcake ToFU 时遇到了这个问题，完整源代码可在https://github.com/Magdoll/cDNA_Cupcake/blob/master/cupcake/io/BioReaders.py 获得。

该程序不断引发 KeyError 并崩溃。当我查看代码时，我看到脚本使用了“除了 KeyError”来避免程序崩溃，但是当我尝试运行它时，程序仍然因 KeyError 而崩溃。有没有人可以帮助我？

这是错误信息

  File "/Users/wuyibo/anaconda2/lib/python2.7/site-packages/cupcake-6.8-py2.7-macosx-10.6-x86_64.egg/cupcake/io/BioReaders.py", line 516, in process

    self.qLen = query_len_dict[self.qID]

KeyError: 'c2468/f1p1/3565'

这是从第 507 行到第 518 行的代码：

if query_len_dict is not None: # over write qLen and qCoverage, should be done LAST

    try:

        self.qLen = query_len_dict[self.qID]

    except KeyError: # HACK for blasr's extended qID

        k = self.qID.rfind('/')

        if k >= 0:

            try:

                self.qLen = query_len_dict[self.qID[:self.qID.rfind('/')]]

            except KeyError:

                self.qLen = query_len_dict[self.qID]

        else:

            raise Exception, "Unable to find qID {0} in the input fasta/fastq!".format(self.qID)

使用“除了 KeyError”，程序不应该崩溃，但是当我运行它时，它仍然因 KeyError 而崩溃。

Answer 1

当你KeyError与qID == 'c2468/f1p1/3565'它就会进入不同的块。然后在 try 块中（第 514 行），它会变成新的KeyError，然后在 except 块中，它尝试执行最初将它带到这里的相同（因为 self.qID 永远不会改变）（即第 516 行与第 509 行相同） .>>> 'c2468/f1p1/3565'[:'c2468/f1p1/3565'.rfind('/')]'c2468/f1p1'可以query_len_dict有钥匙'c2468/f1p1'吗？

Answer 2

我尝试了几种不同的方法，这是最简单的方法：if self.qID in query_len_dict:    print(query_len_dict[self.qID])else:    query_len_dict[self.qID]=0#query_len_dict.get(self.qID, 0)#this one works too instead of the last 4 lines这也适用于字符串，而不仅仅是数字（int，float）参数