Rpy2：如何将字典列表转换为R数据框

Question

我有以下字典的Python列表（来自sqlite3行工厂）：

obs = [{'ave': 0.027, 'pap': 0.277}, 

{'ave': 0.29, 'pap': 0.333}, 

{'ave': 0.25, 'pap': 0.5}]

我想将其转换为R data.frame，以便与rpy2（版本2.3.6）一起使用，因此它看起来像这样

    ave   pap  

1 0.027 0.277 

2 0.29  0.333

3 0.25  0.5

我能够将单个“行”转换为data.frame，如下所示：

robjects.DataFrame(obs[0])

    ave   pap 

1 0.027 0.277 

使用robjects.DataFrame(obs)不起作用... ValueError：obj可以是可迭代类的实例（例如Python dict，rpy2.rlike.container OrdDict或VECSXP类型的rpy2.rinterface.SexpVector的实例。

我也尝试使用将其转换为OrdDict，rpy2.rlike.container.OrdDict(obs)但出现ValueError：太多值无法解压

我认为有许多不同的技术可以实现这一目标，而rpy2和Python中的大量数据结构使我感到困惑。

Answer 1

当obs变大时，创建R数据帧并将其附加会导致性能问题。解决此问题的一种方法是在Python中“转置”结果。# "transpose" the data structure in Pythonfrom collections import defaultdictd = defaultdict(list)for row in obs:    for colname in row:        d[colname].append(row[colname])# Assuming that all data are floats# (if not the case a mapping between SQLite3 types and R vector types is needed)for rpy2.robjects.vectors import FloatVectorfor colname in d:    d[colname] = FloatVector(d[colname])# data framefrom rpy2.robjects import DataFramedataf = DataFrame(d)

Answer 2

我实际上找到了一个答案（这可能不是最有效的，但对我来说是有用的）：在Python中：df = robjects.DataFrame(obs[0])for ob in obs[1:]:    df = df.rbind(robjects.DataFrame(ob))如果有人有更好，更优雅，更有效的解决方案，欢迎他/她发布。