脱机安装R软件包和依赖项

Question

假设我需要在没有Internet连接的（Linux）机器上安装许多软件包。假设我下载了一份cran副本，并将其刻录到DVD上，然后将其带到离线位置：

wget ftp://cran.r-project.org/pub/R/src/contrib/*.tar.gz

我什至可以添加一个PACKAGES文件，其中包含所有源包及其依赖项的概述：

library(tools)

write_PACKAGES()

我如何使用此脱机方式安装源程序包，从而也可以解决依赖关系并从本地文件安装？例如，某人想要安装软件包ggplot2，它具有相当深的依赖性结构。假设ggplot2的源包及其所有依赖项都可以在当前工作目录中作为源包使用。如果我做：

install.packages("ggplot2_0.9.1.tar.gz", repos=NULL)

这将导致错误，因为根本无法解决依赖关系。或者：

install.packages(list.files(pattern="*.tar.gz"), repos=NULL)

但是，这也忽略了依赖关系结构，并尝试按字母顺序安装软件包，这也会失败。

我调查了一下available.packages，contrib.url但是找不到从本地文件（包括其依赖项）安装源程序包的示例。

Answer 1

参考上面的答案，如果安装是在Windows中进行的，则write_PACKAGES（）会生成两个文件：“ / path / to / packages /”目录下的PACKAGES和PACKAGES.gz，其中放置了所有zip文件。在install.packages（）函数能够正确读取单独的PACKAGES文件之前，应删除文件PACKAGES.gz，否则会出现“无法打开压缩文件”错误。

Answer 2

在脱机安装过程中，我遇到了同样的问题。不知何故，它无法通过命令行运行。我下载并提取了所有依赖项（需要检查最低版本），然后将文件夹粘贴到库文件夹中。这样，只有我的问题得到了解决。