R：rJava包安装失败

Question

R：rJava包安装失败

使用install.packages("rJava")命令安装rJava时出现以下错误：

checking Java support in R... present:

interpreter : '/usr/bin/java'

archiver    : '/usr/bin/jar'

compiler    : '/usr/bin/javac'

header prep.: '/usr/bin/javah'

cpp flags   : '-I/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../include -I/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../include/linux'

java libs   : '-L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/lib/amd64/server -L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/lib/amd64 -L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../lib/amd64 -L -L/usr/java/packages/lib/amd64 -L/usr/lib64 -L/lib64 -L/lib -L/usr/lib -ljvm'

checking whether JNI programs can be compiled... yes

checking JNI data types... configure: error: One or more JNI types differ from the corresponding native type. You may need to use non-standard compiler flags or a different compiler in order to fix this.

ERROR: configuration failed for package ‘rJava’

我安装了Java JDK并java -version返回以下内容：

$ java -version

java version "1.6.0_20"

Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.6.0_20-b02)

当谷歌搜索错误时，我发现其他人遇到了同样的问题，但没有找到除了“安装整个JDK，而不仅仅是JRE”之外的解决方案。

我读到的另一件事是运行sudo R CMD javareconf哪个运行非常愉快，没有错误。

有什么想法我的问题是什么？

Answer 1

岂不apt-get install r-cran-rjava一直比较容易？你可以在useR上问我！:)

Answer 2

建议$JAVA_HOME引导我找到类似的解决方案：prompt$ unset JAVA_HOME在调用R.之前