管理R会话中可用内存的技巧

Question

管理R会话中可用内存的技巧

人们使用哪些技巧来管理交互式R会话的可用内存？我使用下面的函数(基于Petr Pikal和David Hinds在2004年发布到r-Help列表中的帖子)来列出(和/或排序)最大的对象，并偶尔使用这些函数来列出(和/或排序)最大的对象。rm()其中一些。但迄今为止最有效的解决办法是.。在内存充足的64位Linux下运行。

还有其他人想分享的好把戏吗？每个邮件一张。

# improved list of objects.ls.objects <- function (pos = 1, pattern, order.by,
                        decreasing=FALSE, head=FALSE, n=5) {
    napply <- function(names, fn) sapply(names, function(x)
                                         fn(get(x, pos = pos)))
    names <- ls(pos = pos, pattern = pattern)
    obj.class <- napply(names, function(x) as.character(class(x))[1])
    obj.mode <- napply(names, mode)
    obj.type <- ifelse(is.na(obj.class), obj.mode, obj.class)
    obj.size <- napply(names, object.size)
    obj.dim <- t(napply(names, function(x)
                        as.numeric(dim(x))[1:2]))
    vec <- is.na(obj.dim)[, 1] & (obj.type != "function")
    obj.dim[vec, 1] <- napply(names, length)[vec]
    out <- data.frame(obj.type, obj.size, obj.dim)
    names(out) <- c("Type", "Size", "Rows", "Columns")
    if (!missing(order.by))
        out <- out[order(out[[order.by]], decreasing=decreasing), ]
    if (head)
        out <- head(out, n)
    out}# shorthandlsos <- function(..., n=10) {
    .ls.objects(..., order.by="Size", decreasing=TRUE, head=TRUE, n=n)}

Answer 1

确保您在一个可复制的脚本中记录您的工作。从时间到时间，重新打开R，然后source()你的剧本。您将清除不再使用的任何内容，并且作为附加的好处将测试您的代码。