为什么有时候把代码压缩之后应用就不能正常运行了？

一段代码（其实是一个网页），用一个工具（我目前用的http://dean.edwards.name/packer/）去掉了所有的空格和注释，但是呢，去掉之后的代码，理论上是可以正常运行的，为什么有时候，压缩之后的css,html,javaScript代码就不能正常运行了？

原谅我这么问问题