无法使用 Numpy 和 Matplotlib 在 Python 中绘制 3D 医学图像

Question

我想使用 Python、Numpy 和 Matplotlib 绘制 3D 医学图像。我一直在尝试使用以下代码段来显示它们，但图像本身没有呈现。

import os

import imageio

import matplotlib.pyplot as plt, numpy as np

from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D

def make_ax(grid=False):

    fig = plt.figure()

    ax = fig.gca(projection='3d')

    ax.set_xlabel("x")

    ax.set_ylabel("y")

    ax.set_zlabel("z")

    ax.grid(grid)

    return ax

x=os.listdir('Path to .dcm images')

print(x)

vol = imageio.volread('Path to .dcm images') 

print(vol.shape)

ax = make_ax(True)

ax.voxels(vol, edgecolors='gray')

plt.show()

Answer 1

voxel根据文档，期望布尔值 - 或者可以被视为布尔值的东西。您正在传递整数数据，任何非零都被视为真。您的大部分数据都是非零的，因此您会得到所显示的大灰色立方体。它的呈现方式没有任何问题 - 您只是选择了错误的方式来可视化您拥有的数据。