为什么 Nibabel 会更改我的文件大小？

Question

我正在处理格式为 nii.gz 的图像。因此，我使用nibabel来打开它们。问题是当我打开图像，将它们转换为 numpy 数组并将它们转换回 Nifti 格式时，输出大小发生了变化。顺序是：

nifti_image = nib.load('/my_path_to_image/image.nii.gz')

np_img = ct_images.get_fdata()

nifti_final = nib.Nifti1Image(data, affine=np.eye(4)) # Convert them to nifti

nib.save(nifti_final , 'image.nii.gz')

初始文件为~45 MB，运行上述代码后，图像为~65 MB. 我知道原始图像是 16 位编码的。我最初的理论是，当转换为 numpy 数组时，它们被编码为64-bit确实如此。所以我尝试了以下方法：

nifti_image = nib.load('/my_path_to_image/image.nii.gz')

np_img = ct_images.get_fdata()

np_img = np_img.astype(numpy.float16, copy=False)

nifti_final = nib.Nifti1Image(data, affine=np.eye(4)) # Convert them to nifti

nib.save(nifti_final , 'image.nii.gz')

但是，输出仍然是相同的大小~65MB。任何想法为什么会发生这种情况？

Answer 1

您应该将原始 nifti 仿射和标题信息添加到输出 nifti。例如，在您的情况下：nifti_final = nib.Nifti1Image(data, nifti_image.affine, nifti_image.header)