如果您的RAW甲基化数据以.idat文件的形式出现（Illumina使用此格式），请查看methylpreppython程序包（及其相关的methylcheck程序包以进行绘图）。对于甲基化数据，大多数人将样品标为beta distribution或m_value plot表示每个探针的甲基化百分比（但实际上是从0到1的分数，而不是百分比）。使用将是这样的：CLI: `python -m methylprep process -d <folder_path_of_idats> --all`python:>>>import methylcheck>>>df = methylcheck.load(<path>) # creates a pandas dataframe of all samples in the folder you are in, or path specified.>>>methylcheck.sample_plot(df)下面的jupyter笔记本中产生的情节示例