index.html：
<!DOCTYPE HTML>
<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />
<title>系好安全带,准备启航</title>
<!--引入外部文件的方式-->
<script type="text/javascript" src="script.js">
//多行注释
/*我是多行注释！
我需要隐藏，
否则会报错哦！*/
//在页面中显示文字
document.write("系好安全带,准备启航--目标JS");
//页面中弹出提示框
boom2();
//单行注释
//我是单行注释，我也要隐藏起来！
</script>
</head>
<body>
</body>
</html>script.js ：
//编写JS代码
function boom2(){
alert("准备好了，起航吧！");
}<script src="script.js" type="text/javascript"></script>//它作为引用，这就是完整的句子了，标签内不要再加内容。以下为JS入门篇第一章的部分内容：<script>标签成对出现，并把JavaScript代码写在<script></script>之间。而JS文件不能直接运行，需嵌入到HTML文件中执行，我们需在HTML中添加<script src="script.js" type="text/javascript"></script>，就可将JS文件嵌入HTML文件中。也就是说引用路径用的标签和写内容用的要分开，性质不同。
<script type="text/javascript">
document.write("系好安全带,准备启航--目标JS");
boom2();//这个是调用函数的，首先要有函数。
</script>
测试了一下，你的问题是 HTML 里的boom2()函数没有被调用执行，所以会运行出错
--------------我是分割线--------------
//页面中弹出提示框
boom2(); //定义的这个函数这样子写出来是不会调用运行的。。。
//解释原因：当调用该函数时，会执行函数内的代码。可以在某事件发生时直接调用函数（比如当用户点击按钮时），也就是说，函数必须被调用，才能执行//
//单行注释
//我是单行注释，我也要隐藏起来！
--------------我是分割线--------------
引入的js文件为一条 自己在html写的内部js为一条
<script src="..." type=""></script> //这是你引入的js
<script type="">...</script> //这是你在html内部写的js
继续学习下一节吧
其实很简单,对于初学者来说很容易在引入script文件的标签中编写另外的javascript代码(<script type="text/javascript" src="script.js">)，而只要将javascript代码编写到另外一个script中即可（不要再引入script文件了）