这个问题分两种情况：
- new Vue({el: ‘#app’})
- 单文件组件template中根元素只能有一个
要解释这个问题，最好的方式就是直接看源码
一、Vue实例
一个vue实例的创建大致分为如下两个步骤
以vue2.5.2版本为例：
- 调用_init方法初始化事件和生命周期，对options做选项合并
- 看传进来的参数有没有el选项，如果有则调用$mount来挂载模板
_init方法在Vue的构造函数中被调用
_init方法的创建在initMixin中，可以看到在Vue的原型对象下添加了_init方法，里面的内容可以不管，大部分都是在做选项合并的操作，直接跳到我圈出来的地方，也就是我们接下来要说的第二步
$mount代码非常简单，判断el有没有、是不是浏览器环境，是就把query函数的返回值给它，否则赋值为undefined，做完这些事情之后调用mountComponent函数，这个函数看名字就知道是用来挂载模板
我们来看看query函数
query函数的作用就是判断传进来的el是不是元素，如果是就直接返回，否则使用浏览器document的querySelector API来获取它
到这里是否已经恍然大悟，原来答案这么简单，querySelector只会返回第一个匹配的dom元素，因此就算你写了两个顶层元素也默认只会选择第一个dom作为入口
如果你还不了解querySelector，请阅读如下文档：
因此，当我们实例化一个Vue时如果写了两个入口，现在你知道答案了吗？
let vm = new Vue({
el:'#app',
data:{ msg: '你好' }
})
<body>
<div id='app'>{{msg}}</div>
<div id='app'>{{msg}}</div>
</body>
二、单文件组件
.vue文件会通过vue-loader转换成js代码，在你通过import语句导入一个.vue时，实际上就是导入这个组件的实例，与上面同理，实例需要一个入口，如果在template标签中写了两个根元素，它也不知道将哪个元素作为组件实例的入口，因此干脆就告诉你只需要一个根元素
The template root requires exactly one element
源码如下所示，圈出来的这段代码的作用就是解析template并转换成渲染函数，最终$mount方法被调用时会将解析好的模板插入到对应的节点中