手记

一条数据的HBase之旅,简明HBase入门教程-开篇

常见的HBase新手问题:

1. 什么样的数据适合用HBase来存储?

2. 既然HBase也是一个数据库,能否用它将现有系统中昂贵的Oracle替换掉?

3. 存放于HBase中的数据记录,为何不直接存放于HDFS之上?

4. 能否直接使用HBase来存储文件数据?

5. Region(HBase中的数据分片)迁移后,数据是否也会被迁移?

6. 为何基于Spark/Hive分析HBase数据时性能较差?



开篇:

用惯了Oracle/MySQL的同学们,心目中的数据表,应该是长成这样的:

这种表结构规整,每一行都有固定的列构成,因此,非常适合结构化数据的存储。但在NoSQL领域,数据表的模样却往往换成了另外一种"画风":

这种表结构规整,每一行都有固定的列构成,因此,非常适合结构化数据的存储。但在NoSQL领域,数据表的模样却往往换成了另外一种"画风":

行由看似"杂乱无章"的列组成,行与行之间也无须遵循一致的定义,而这种定义恰好符合半结构化数据或非结构化数据的特点。本文所要讲述的HBase,就属于该派系的一个典型代表。这些"杂乱无章"的列所构成的多行数据,被称之为一个"稀疏矩阵",而上图中的每一个"黑块块",在HBase中称之为一个KeyValue。

Apache HBase官方给出了这样的定义:

Apache HBase™ is the Hadoop database, adistributed,scalable,big data store.

即:Apache HBase是基于Hadoop构建的一个分布式的、可伸缩海量数据存储系统

HBase常被用来存放一些海量的(通常在TB级别以上)结构比较简单的数据,如历史订单记录,日志数据,监控Metris数据等等,HBase提供了简单的基于Key值的快速查询能力。HBase在国内市场已经取得了非常广泛的应用,在搜索引擎中,也可以看出来,HBase在国内呈现出了逐年上升的势态:

从Apache HBase所关联的github项目的commits统计信息来看,也可以看出来该项目非常活跃:

需要说明的一点:HBase中的每一次Commit,都已经过社区Commiter成员严格的Review,在Commit之前,一个Patch可能已经被修改了几十个版本,令人欣喜的是国内的开发者也积极参与到了HBase社区贡献中,而且被社区接纳多名PMC以及Committer成员。

关于国内committer成员信息参考另一篇文章 : https://www.jianshu.com/p/bf19986518ba

本文将以一条数据在HBase中的“旅程”为线索,介绍HBase的核心概念与流程,几乎每一部分都可以展开成一篇独立的长文,但本文旨在让读者能够快速的了解HBase的架构轮廓,所以很多特性/流程被被一言带过,但这些特性在社区中往往经历了漫长的开发过程。至于讲什么以及讲到什么程度,本文都做了艰难的取舍,在讲解的过程中,将会穿插解答本文开始所提出的针对初学者的一些常见问题。

本文适用于HBase新手,而对于具备一定经验的HBase开发人员,相信本文也可以提供一些有价值的参考。本文内容基于HBase 2.0 beta 2版本,对比于1.0甚至是更早期的版本,2.0出现了大量变化,下面这些问题的答案将揭示部分关键的变化(新手可以直接跳过这些问题):

1. HBase meta Region在哪里提供服务?

2. HBase是否可以保证单行操作的原子性?

3. Region中写WAL与写MemStore的顺序是怎样的?

4. 你是否遇到过Region长时间处于RIT的状态?

5. 你认为旧版本中Assignment Manager的主要问题是什么?

6. 在面对Full GC问题时,你尝试做过哪些优化?

7.你是否深究过HBase Compaction带来的“写放大”有多严重?

8. HBase的RPC框架存在什么问题?导致查询时延毛刺的原因有哪些?

本系列文章的整体行文思路如下:

1. 介绍HBase数据模型

2. 基于数据模型介绍HBase的适用场景

3. 快速介绍集群关键角色以及集群部署建议

4. 示例数据介绍

5. 写数据流程

6. 读数据流程

7. 数据更新

8. 负载均衡机制

9. HBase如何存储小文件数据

这些内容将会被拆成几篇文章。至于集群服务故障的处理机制,集群工具,周边生态,性能调优以及最佳实践等进阶内容,暂不放在本系列文章范畴内。


约定:


1. 本文范围内针对一些关键特性/流程,使用了加粗以及加下划线的方式做了强调,如"ProcedureV2"。这些特性往往在本文中仅仅被粗浅提及,后续计划以独立的文章来介绍这些特性/流程。

2. 术语缩写:对于一些进程/角色名称,在本文范围内可能通过缩写形式来表述:


数据模型:


1. RowKey

用来表示唯一一行记录的主键,HBase的数据是按照RowKey的字典顺序进行全局排序的,所有的查询都只能依赖于这一个排序维度。

通过下面一个例子来说明一下"字典排序"的原理:

RowKey列表{"abc", "a","bdf", "cdf", "def"} 按字典排序后的结果为 : {"a", "abc", "bdf", "cdf","defg"}

也就是说,当两个RowKey进行排序时,先对比两个RowKey的第一个字节,如果相同,则对比第二个字节,依次类推...如果在对比到第M个字节时,已经超出了其中一个RowKey的字节长度,那么,短的RowKey要被排在另外一个RowKey的前面。

2. 稀疏矩阵

参考了Bigtable,HBase中一个表的数据是按照稀疏矩阵的方式组织的,"开篇"部分给出了一张关于HBase数据表的抽象图,我们再结合下表来加深大家关于"稀疏矩阵"的印象:

看的出来:每一行中,列的组成都是灵活的,行与行之间并不需要遵循相同的列定义, 也就是HBase数据表"schema-less"的特点。

3. Region

区别于Cassandra/DynamoDB的"Hash分区"设计,HBase中采用了"Range分区",将Key的完整区间切割成一个个的"Key Range" ,每一个"Key Range"称之为一个Region。

也可以这么理解:将HBase中拥有数亿行的一个大表,横向切割成一个个"子表",这一个个"子表"就是Region

Region是HBase中负载均衡的基本单元,当一个Region增长到一定大小以后,会自动分裂成两个。

4. Column Family

如果将Region看成是一个表的横向切割,那么,一个Region中的数据列的纵向切割,称之为一个Column Family。每一个列,都必须归属于一个Column Family,这个归属关系是在写数据时指定的,而不是建表时预先定义。

5. KeyValue

KeyValue的设计不是源自Bigtable,而是要追溯至论文"The log-structured merge-tree(LSM-Tree)"。每一行中的每一列数据,都被包装成独立的拥有特定结构的KeyValue,KeyValue中包含了丰富的自我描述信息:

看的出来,KeyValue是支撑"稀疏矩阵"设计的一个关键点:一些Key相同的任意数量的独立KeyValue就可以构成一行数据。但这种设计带来的一个显而易见的缺点:每一个KeyValue所携带的自我描述信息,会带来显著的数据膨胀


适用场景


在介绍完了HBase的数据模型以后,我们可以回答本文一开始的前两个问题:

1.   什么样的数据适合用HBase来存储?

2.   既然HBase也是一个数据库,能否用它将现有系统中昂贵的Oracle替换掉?

HBase的数据模型比较简单,数据按照RowKey排序存放,适合HBase存储的数据,可以简单总结如下:

以实体为中心的数据

    实体可以包括但不限于如下几种:描述这些实体的,可以有基础属性信息、实体关系(图数据)、所发生的事件(如交易记录、车辆轨迹点)等等。

    1. 自然人/账户/手机号/车辆相关数据

    2. 用户画像数据(含标签类数据)

    3. 图数据(关系类数据)

以事件为中心的数据

    1. 监控数据

    2. 时序数据

    3. 实时位置类数据

    4. 消息/日志类数据

上面所描述的这些数据,有的是结构化数据,有的是半结构化非结构化数据

HBase的“稀疏矩阵”设计,使其应对非结构化数据存储时能够得心应手,但在我们的实际用户场景中,结构化数据存储依然占据了比较重的比例。由于HBase仅提供了基于RowKey的单维度索引能力,在应对一些具体的场景时,依然还需要基于HBase之上构建一些专业的能力,如:

    1. OpenTSDB时序数据存储,提供基于Metrics+时间+标签的一些组合维度查询与聚合能力

    2. GeoMesa时空数据存储,提供基于时间+空间范围的索引能力

    3. JanusGraph图数据存储,提供基于属性、关系的图索引能力

HBase擅长于存储结构简单的海量数据但索引能力有限,而Oracle等传统关系型数据库(RDBMS)能够提供丰富的查询能力,但却疲于应对TB级别的海量数据存储,HBase对传统的RDBMS并不是取代关系,而是一种补充


HBase与HDFS

我们都知道HBase的数据是存储于HDFS里面的,相信大家也都有这么的认知:我们都知道HBase的数据是存储于HDFS里面的,相信大家也都有这么的认知:

HBase是一个分布式数据库,HDFS是一个分布式文件系统

理解了这一点,我们先来粗略回答本文已开始提出的其中两个问题:

3. HBase中的数据为何不直接存放于HDFS之上?

HBase中存储的海量数据记录,通常在几百Bytes到KB级别,如果将这些数据直接存储于HDFS之上,会导致大量的小文件产生,为HDFS的元数据管理节点(NameNode)带来沉重的压力。

4. 文件能否直接存储于HBase里面?

如果是几MB的文件,其实也可以直接存储于HBase里面,我们暂且将这类文件称之为小文件,HBase提供了一个名为MOB的特性来应对这类小文件的存储。但如果是更大的文件,强烈不建议用HBase来存储,关于这里更多的原因,希望你在详细读完本系列文章所有内容之后能够自己解答。



集群角色

关于集群环境,你可以使用国内外大数据厂商的平台,如Cloudera,Hontonworks以及国内的华为,都发行了自己的企业版大数据平台,另外,华为云、阿里云中也均推出了全托管式的HBase服务。

我们假设集群环境已经Ready了,先来看一下集群中的关键角色

相信大部分人对这些角色都已经有了一定程度的了解,我们快速的介绍一下各个角色在集群中的主要职责:

ZooKeeper

在一个拥有多个节点的分布式系统中,假设,只能有一个节点是主节点,如何快速的选举出一个主节点而且让所有的节点都认可这个主节点?这就是HBase集群中存在的一个最基础命题。

利用ZooKeeper就可以非常简单的实现这类"仲裁"需求,ZooKeeper还提供了基础的事件通知机制,所有的数据都以 ZNode的形式存在,它也称得上是一个"微型数据库"。

NameNode

HDFS作为一个分布式文件系统,自然需要文件目录树的元数据信息,另外,在HDFS中每一个文件都是按照Block存储的,文件与Block的关联也通过元数据信息来描述。NameNode提供了这些元数据信息的存储。

DataNode

HDFS的数据存放节点。

RegionServer

HBase的数据服务节点。

Master

HBase的管理节点,通常在一个集群中设置一个主Master,一个备Master,主备角色的"仲裁"由ZooKeeper实现。 Master主要职责:

①负责管理所有的RegionServer。

②建表/修改表/删除表等DDL操作请求的服务端执行主体。

③管理所有的数据分片(Region)到RegionServer的分配。

④如果一个RegionServer宕机或进程故障,由Master负责将它原来所负责的Regions转移到其它的RegionServer上继续提供服务。

⑤Master自身也可以作为一个RegionServer提供服务,该能力是可配置的。

集群部署建议

如果基于物理机/虚拟机部署,通常建议:

1. RegionServer与DataNode联合部署,RegionServer与DataNode按1:1比例设置。

这种部署的优势在于,RegionServer中的数据文件可以存储一个副本于本机的DataNode节点中,从而在读取时可以利用HDFS中的"短路径读取(Short Circuit)"来绕过网络请求,降低读取时延。

2. 管理节点独立于数据节点部署

如果是基于物理机部署,每一台物理机节点上可以设置几个RegionServers/DataNodes来提升资源使用率。

也可以选择基于容器来部署,如在HBaseCon Asia 2017大会知乎的演讲主题中,就提到了知乎基于Kubernetes部署HBase服务的实践。

对于公有云HBase服务而言,为了降低总体拥有成本(TCO),通常选择"计算与存储物理分离"的方式,从架构上来说,可能导致平均时延略有下降,但可以借助于共享存储底层的IO优化来做一些"弥补"。

HBase集群中的RegionServers可以按逻辑划分为多个Groups,一个表可以与一个指定的Group绑定,可以将RegionServer Group理解成将一个大的集群划分成了多个逻辑子集群,借此可以实现多租户间的隔离,这就是HBase中的RegionServer Group特性。

示例数据

以我们日常生活都熟悉的手机通话记录的存储为例,先简单给出示例数据的字段定义:

如上定义与电信领域的通话记录字段定义相去甚远,本文力求简洁,仅给出了最简单的示例。如下是"虚构"的样例数据:

在本文大部分内容中所涉及的一条数据,是上面加粗的最后一行"MSISDN1"为"13400006666"这行记录。

在本系列文章的流程图中,我们将会使用一个红色的五角星来表示该数据所在的位置。

写数据之前:创建连接


Login

在启用了安全特性的前提下,Login阶段是为了完成用户认证(确定用户的合法身份),这是后续一切安全访问控制的基础。

当前Hadoop/HBase仅支持基于Kerberos的用户认证,ZooKeeper除了Kerberos认证,还能支持简单的用户名/密码认证,但都基于静态的配置,无法动态新增用户。如果要支持其它第三方认证,需要对现有的安全框架做出比较大的改动。

创建Connection

Connection可以理解为一个HBase集群连接的抽象,建议使用ConnectionFactory提供的工具方法来创建。因为HBase当前提供了两种连接模式:同步连接,异步连接,这两种连接模式下所创建的Connection也是不同的。我们给出ConnectionFactory中关于获取这两种连接的典型方法定义:

Connection中主要维护着两类共享的资源

线程池

Socket连接

这些资源都是在真正使用的时候才会被创建,因此,此时的连接还只是一个"虚拟连接"。

写数据之前:创建数据表

DDL操作的抽象接口 - Admin

Admin定义了常规的DDL接口,列举几个典型的接口:

预设合理的数据分片 - Region

分片数量会给读写吞吐量带来直接的影响,因此,建表时通常建议由用户主动指定划分Region分割点,来设定Region的数量。

HBase中数据是按照RowKey的字典顺序排列的,为了能够划分出合理的Region分割点,需要依据如下几点信息:

1.Key的组成结构

2.Key的数据分布预估

如果不能基于Key的组成结构来预估数据分布的话,可能会导致数据在Region间的分布不均匀

3.读写并发度需求

依据读写并发度需求,设置合理的Region数量

为表定义合理的Schema

既然HBase号称"schema-less"的数据存储系统,那何来的是"schema "?的确,在数据库范式的支持上,HBase非常弱,这里的"schema",主要指如下一些信息的设置:

1. NameSpace设置

2. Column Family的数量

3. 每一个Column Family中所关联的一些关键配置

① Compression

HBase当前可以支持Snappy,GZ,LZO,LZ4,Bzip2以及ZSTD压缩算法

② DataBlock Encoding

HBase针对自身的特殊数据模型所做的一种压缩编码

③ BloomFilter

可用来协助快速判断一条记录是否存在

④ TTL

指定数据的过期时间

⑤ StoragePolicy

指定Column Family的存储策略,可选项有:"ALL_SSD","ONE_SSD","HOT","WARM","COLD","LAZY_PERSIST"

HBase中并不需要预先设置Column定义信息,这就是HBase schema less设计的核心。

Client发送建表请求到Master

建表的请求是通过RPC的方式由Client发送到Master:

    1.RPC接口基于Protocol Buffer定义

    2.建表相关的描述参数,也由Protocol Buffer进行定义及序列化

Client端侧调用了Master服务的什么接口,参数是什么,这些信息都被通过RPC通信传输到Master侧,Master再依据这些接口\参数描述信息决定要执行的操作。2.0版本中,HBase目前已经支持基于Netty的异步RPC框架

关于HBase RPC框架早期的HBase RPC框架,完全借鉴了Hadoop中的实现,那时,Netty项目尚不盛行。

Master侧接收到Client侧的建表请求以后,一些主要操作包括:

1. 生成每一个Region的描述信息对象HRegionInfo,这些描述信息包括:Region ID, Region名称,Key范围,表名称等信息。

2. 生成每一个Region在HDFS中的文件目录。

3. 将HRegionInfo信息写入到记录元数据的hbase:meta表中。

说明:

meta表位于名为"hbase"的namespace中,因此,它的全称为"hbase:meta"。但在本系列文章范畴内,常将其缩写为"meta"。

整个过程中,新表的状态也是记录在hbase:meta表中的,而不用再存储在ZooKeeper中。

如果建表执行了一半,Master进程故障,如何处理?这里是由HBase自身提供的一个名为Procedure(V2)的框架来保障操作的事务性的,备Master接管服务以后,将会继续完成整个建表操作。

一个被创建成功的表,还可以被执行如下操作:

1.Disable将所有的Region下线,该表暂停读写服务

2.Enable将一个Disable过的表重新Enable,也就是上线所有的Region来正常提供读写服务

3.Alter更改表或列族的描述信息

Master分配Regions


新创建的所有的Regions,通过AssignmentManager将这些Region按照轮询(Round-Robin)的方式分配到每一个RegionServer中,具体的分配计划是由LoadBalancer来提供的。

AssignmentManager负责所有Regions的分配/迁移操作,Master中有一个定时运行的线程,来检查集群中的Regions在各个RegionServer之间的负载是否是均衡的,如果不均衡,则通过LoadBalancer生成相应的Region迁移计划,HBase中支持多种负载均衡算法,有最简单的仅考虑各RegionServer上的Regions数目的负载均衡算法,有基于迁移代价的负载均衡算法,也有数据本地化率优先的负载均衡算法,因为这一部分已经提供了插件化机制,用户也可以自定义负载均衡算法。

总结


本文主要介绍了如下内容:

1. HBase项目概述,呈现了HBase社区的活跃度以及搜索引擎热度等信息

2. HBase数据模型部分,讲到了RowKey,稀疏矩阵,Region,Column Family,KeyValue等概念

3. 基于HBase的数据模型,介绍了HBase的适合场景(以实体/事件为中心的简单结构的数据)

4. 介绍了HBase与HDFS的关系

5. 介绍了集群的关键角色:ZooKeeper, Master, RegionServer,NameNode, DataNode

6. 集群部署建议

7. 给出了一些示例数据

8. 写数据之前的准备工作:建立集群连接,建表(建表时应该定义合理的Schema以及设置合理的Region数量),建表由Master处理,新创建的Regions由Region AssignmentManager负责分配到各个RegionServer。

下一篇文章将正式开始介绍写数据的流程。

致谢


感谢Apache HBase PMC成员Ted Yu,李钰,张铎对本文中与2.0版本相关特性/流程描述内容方面的Review,感谢王琼、向宏伟以及陈土炎等几位同学给本文内容方面提出的宝贵意见。感谢毕美杰为本文提供的漂亮的封面图片:)



作者:中国HBase技术社区
链接:https://www.jianshu.com/p/3b391c9922f8


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