本章的主题是TF中的混合编程,以Python与C/C++混合编程为例.
按进度来说,现在应该写点TF使用教程,让大家熟悉一下tensorflow的使用,但是我发现现在这方面的资料和书籍已经很多了,这里就不再赘述了,毕竟时间有限,留给更有意义的事情。
做到熟悉TF使用的最好的方式就是动手实践具体的例子,官网提供的教程就不错。我建议继续阅读本章之前,读者通过这些实际操作的例子,熟悉一下TensorFlow的使用流程。
下面进入本章的主题。
连接两个世界的传送门
回忆上一章中,我们编译、安装tensorflow的方式如下:
首先,bazel build目标
$ bazel build --config=opt //tensorflow/tools/pip_package:build_pip_package
然后,启动目标程序,生成wheel格式安装包到tmp/tensorflow_pkg目录:
$ bazel-bin/tensorflow/tools/pip_package/build_pip_package /tmp/tensorflow_pkg
最后,通过tensorflow的pip包管理器安装tensorflow的安装包:
$ sudo pip install /tmp/tensorflow_pkg/tensorflow-1.6.0-py2-none-any.whl
这个流程我相信大家都已经很熟悉了,我们就从这个顶级的构建目标入手,自顶向下分析TF中Python的调用是如何进入C/C++世界的。
第二章中我们提到,上面命令中的构建目标 //tensorflow/tools/pip_package:build_pip_package 其实是一个可执行的 shell 脚本,通过 bazel 的 sh_binary 规则生成,sh_binary 的规则会将脚本依赖的文件拷贝或则生成(如果被依赖项也是bazel的规则定义的目标的话)到runfiles目录下,脚本build_pip_package.sh的工作就是将这些文件打包成一个wheel格式的安装包。
第一章中,我们学习到tf的内核是由C++写成的,支持的前端API有Python,Go,Java,这些前端语言接口基本都是对C API的封装;那么我们把TF的整个工程分为两个部门来分别学习:接口部分和内核部分;我们还知道,接口部分通往内核部分的最终都会通过//tensorflow/c:c_api。
因此,我们来看下Python的顶级目标与c_api的关系。这里需要用到了 bazel 的query命令。
我们在tf工程根目录执行下面的命令:
$ bazel query 'allpaths(//tensorflow/tools/pip_package:build_pip_package, //tensorflow/c:c_api)' --output graph | dot -v -Tpng -o dep_paths.in
命令的作用是找到bazel目标 //tensorflow/tools/pip_package:build_pip_package 到目标 //tensorflow/c:c_api 的所有依赖路径,并将结果输出为图片:
图3:build_pip_package到c_api的所以依赖路径
这用到了graphviz的dot命令,graphviz的安装也很简单:
$ sudo apt-get install graphviz
图3是一个有向图,每一条有向边代表源节点对目的节点的依赖关系,可以看到涉及的工程目标非常多,依赖也繁杂,但是还是可以分析的;首先,我们注意这两个节点:其中一个节点只有出度没有入度,这就是我们都顶级构建目标 //tensorflow/tools/pip_package:build_pip_package
图4:build_pip_package 节点
<center>图4:build_pip_package 节点</center>
另一个节点只有入度,没有出度,就是我们的 //tensorflow/c:c_api 节点:
图5:c_api节点
<center>图5:c_api节点</center>
另外,还有一个节点比较引人注意,那就是 //tensorflow/python:pywrap_tensorflow_internal,我们注意到这样一个特征,整张图在这个节点上分成了上下两个"团体",每个团体内部的依赖比较复杂,暂时先不用管,但是上层"团体"对下层"团体"的依赖都经过//tensorflow/python:pywrap_tensorflow_internal节点:
图6:pywrap_tensorflow_internal
<center>图6:pywrap_tensorflow_internal</center>
直观感觉,这个节点至关重要,是连接了两个世界的"传送门"。
Python扩展pywrap_tensorflow_internal
找到定义pywrap_tensorflow_internal的BUILD文件//tensorflow/python/BUILD:
tf_py_wrap_cc( name = "pywrap_tensorflow_internal", srcs = ["tensorflow.i"], swig_includes = [ "client/device_lib.i", "client/events_writer.i", "client/tf_session.i", "client/tf_sessionrun_wrapper.i", "framework/cpp_shape_inference.i", "framework/python_op_gen.i", "grappler/cost_analyzer.i", "grappler/tf_optimizer.i", "lib/core/py_func.i", "lib/core/strings.i", "lib/io/file_io.i", "lib/io/py_record_reader.i", "lib/io/py_record_writer.i", "platform/base.i", "training/quantize_training.i", "training/server_lib.i", "util/kernel_registry.i", "util/port.i", "util/py_checkpoint_reader.i", "util/stat_summarizer.i", "util/transform_graph.i", ], deps = [ ":cost_analyzer_lib", ":cpp_shape_inference", ":kernel_registry", ":numpy_lib", ":py_func_lib", ":py_record_reader_lib", ":py_record_writer_lib", ":python_op_gen", ":tf_session_helper", "//tensorflow/c:c_api", "//tensorflow/c:checkpoint_reader", "//tensorflow/c:tf_status_helper", "//tensorflow/core/distributed_runtime/rpc:grpc_server_lib", "//tensorflow/core/distributed_runtime/rpc:grpc_session", "//tensorflow/core/grappler:grappler_item", "//tensorflow/core/grappler:grappler_item_builder", "//tensorflow/core/grappler/clusters:single_machine", "//tensorflow/core/grappler/optimizers:meta_optimizer", "//tensorflow/core:lib", "//tensorflow/core:reader_base", "//tensorflow/core/debug", "//tensorflow/core/distributed_runtime:server_lib", "//tensorflow/tools/graph_transforms:transform_graph_lib", "//tensorflow/tools/tfprof/internal:print_model_analysis", "//util/python:python_headers", ] + (tf_additional_lib_deps() + tf_additional_plugin_deps() + tf_additional_verbs_deps() + tf_additional_mpi_deps()), )
这里的tf_py_wrap_cc是bazel的宏函数。那么宏函数tf_py_wrap_cc的作用是什么?这里srcs和swig_includes属性里的扩展名为 .i 文件又是什么呢?
找到宏函数tf_py_wrap_cc定义的文件 /tensorflow/tensorflow.bzl :
def tf_py_wrap_cc(name, srcs, swig_includes=[], deps=[], copts=[], **kwargs): module_name = name.split("/")[-1] # Convert a rule name such as foo/bar/baz to foo/bar/_baz.so # and use that as the name for the rule producing the .so file. cc_library_name = "/".join(name.split("/")[:-1] + ["_" + module_name + ".so"]) cc_library_pyd_name = "/".join( name.split("/")[:-1] + ["_" + module_name + ".pyd"]) extra_deps = [] _py_wrap_cc( name=name + "_py_wrap", srcs=srcs, swig_includes=swig_includes, deps=deps + extra_deps, toolchain_deps=["//tools/defaults:crosstool"], module_name=module_name, py_module_name=name) ... ...
函数的前半部分,主要就是调用一个自定义规则 _py_wrap_cc,此规则声明同在tensorflow/tensorflow.bzl文件中,内容如下:
_py_wrap_cc = rule( # # 定义规则的输入属性名称,数据类型,是否必须以及默认值等 # attrs={ "srcs": attr.label_list( mandatory=True, allow_files=True,), "swig_includes": attr.label_list( cfg="data", allow_files=True,), "deps": attr.label_list( allow_files=True, providers=["cc"],), "toolchain_deps": attr.label_list( allow_files=True,), "module_name": attr.string(mandatory=True), "py_module_name": attr.string(mandatory=True), "_swig": attr.label( default=Label("@swig//:swig"), executable=True, cfg="host",), "_swiglib": attr.label( default=Label("@swig//:templates"), allow_files=True,), }, # # 定义规则的输出 # outputs={ "cc_out": "%{module_name}.cc", "py_out": "%{py_module_name}.py", }, # # 定义规则的实现函数 # implementation=_py_wrap_cc_impl,)
规则声明中,定义了规则的属性、属性的变量类型以及默认取值、规则的输出以及实现函数;_py_wrap_cc规则的实现在函数_py_wrap_cc_impl中,我们将仔细分析一下这个函数。
注:宏函数和自定义规则是bazel支持的两个扩展机制,两则是有差别的, 限于篇幅这里就不仔细介绍了。可以参考 [官网](https://docs.bazel.build/versions/master/skylark/concepts.html)。暂时读者只要能更随本人思路就可以,细节可以之后再去学习,本人尽力保证在读者不熟悉bazel 的情况下也能理解本文内容。
在详细分析_py_wrap_cc_impl函数之前,我们需要补充一点关于Python和C/C++混合编程的知识。
SWIG
图7:Python与C/C++混合编程的两种模式
Python和C/C++的混合编程存在两种编程模式:扩展与嵌入,这里主要介绍前一种。C/C++编写Pyton扩展过程如下:
图8:第一步、编写封装函数
图9:第二步、编写模块初始话函数
图10:完整的扩展例子
可以看到,手动完成扩展的编写还是挺低效的,最后还需要将编写完的封装代码和源码一起编译成动态链接库,限于篇幅,这里就不具体介绍了;我们来介绍一个自动化完成扩展编写的工具SWIG。
图11:swig简介
SWIG是一个接口编译工具,连接C/C++代码与脚本语言Perl.Python,Ruby,Tcl的桥梁。SWIG为C/C++头文件自动生成包装代码,提供给脚本语言使用。
我们来看一个例子,假如我们有这样一个C代码文件example.c,其中包含了想要提供给其他语言如Perl,Python,java,C#代码使用的方法:
/* File : example.c */ #include <time.h> double My_variable = 3.0; int fact(int n) { if (n <= 1) return 1; else return n*fact(n-1); } int my_mod(int x, int y) { return (x%y); } char *get_time() { time_t ltime; time(<ime); return ctime(<ime); }
那么首先我们需要创建一个"接口文件",扩展名为 .i:
/* example.i */%module example %{/* Put header files here or function declarations like below */extern double My_variable;extern int fact(int n);extern int my_mod(int x, int y);extern char *get_time(); %}extern double My_variable;extern int fact(int n);extern int my_mod(int x, int y);extern char *get_time();
然后就可以构建其他语言的模块了,例如可以执行如下命令构建Python模块:
$ swig -python example.i $ gcc -c example.c example_wrap.c -I/usr/local/include/python2.1$ ld -shared example.o example_wrap.o -o _example.so
然后就可以调用生成的Python模块了:
>>> import example>>> example.fact(5)120>>> example.my_mod(7,3)1>>> example.get_time()'Sun Feb 11 23:01:07 1996'>>>
可以通过执行下列命令生成Java模块:
$ swig -java example.i $ gcc -c example.c example_wrap.c -I/c/jdk1.3.1/include -I/c/jdk1.3.1/include/win32 $ gcc -shared example.o example_wrap.o -mno-cygwin -Wl, --add-stdcall-alias -o example.dll
然后可以编写java代码,调用此模块:
/* file main.java */public class main{ public static void main(String argv[]){ System.loadLobrary('example'); System.out.println(example.getMy_variable()); System.out.println(example.fact(5)); System.out.println(example.get_time()); } }
最后执行调用:
$ javac main.java $ java main3.0120Mon Mar 4 18:20:31 2002$
有了这些准备知识后,我们可以开始分析_py_wrap_cc_impl函数了:
# Bazel rules for building swig files.def _py_wrap_cc_impl(ctx): ## ## 下面的代码在构造SWIG的参数 ## srcs = ctx.files.srcs if len(srcs) != 1: fail("Exactly one SWIG source file label must be specified.", "srcs") module_name = ctx.attr.module_name src = ctx.files.srcs[0] inputs = set([src]) inputs += ctx.files.swig_includes for dep in ctx.attr.deps: inputs += dep.cc.transitive_headers inputs += ctx.files._swiglib inputs += ctx.files.toolchain_deps swig_include_dirs = set(_get_repository_roots(ctx, inputs)) swig_include_dirs += sorted([f.dirname for f in ctx.files._swiglib]) ## ## swig的命令行参数:-c++表示启动C++解析,-python表示输出python的 ## wrapper代码,-module设置模块名称,-o表示输出文件名称,-outdir ## 表示输出目录路径,-l表示包含的SWIG的库文件名称,包括用户提供的.i文件 ## 以及需要的SWIG库文件(也是一些.i文件),-I表示把参数路径添 ## 加到SWIG的include查找路径。 ## args = [ "-c++", "-python", "-module", module_name, "-o", ctx.outputs.cc_out.path, "-outdir", ctx.outputs.py_out.dirname ] args += ["-l" + f.path for f in ctx.files.swig_includes] args += ["-I" + i for i in swig_include_dirs] args += [src.path] outputs = [ctx.outputs.cc_out, ctx.outputs.py_out] ## ## 调用SWIG命令,生成swig files:ctx.action函数会启动一个 ## 可执行文件或脚本executable, 启动参数arguments, inputs ## 表示表示输入文件,outputs表示输出文件。 ## ctx.action( executable=ctx.executable._swig, arguments=args, inputs=list(inputs), outputs=outputs, mnemonic="PythonSwig", progress_message="SWIGing " + src.path) return struct(files=set(outputs))
C/C++的Python插件封装代码通过SWIG生成之后,就可以编译Python的插件了,这就是函数tf_py_wrap_cc后半部分所完成的工作:
def tf_py_wrap_cc(name, srcs, swig_includes=[], deps=[], copts=[], **kwargs): ... ... ## ## module_name + ".cc"是上面介绍的_py_wrap_cc规则的输出文件 ## 也就是C/C++代码的Python封装代码,与dep中的C/C++代码一起, ## 通过cc_binary规则,生成动态链接库cc_library_name。 ## native.cc_binary( name=cc_library_name, srcs=[module_name + ".cc"], copts=(copts + [ "-Wno-self-assign", "-Wno-sign-compare", "-Wno-write-strings" ] + tf_extension_copts()), linkopts=tf_extension_linkopts() + extra_linkopts, linkstatic=1, linkshared=1, deps=deps + extra_deps) ## ## 定义一个生成规则,执行拷贝命令cp,将动态链接库cc_library_name拷贝一份, ## 名称为cc_library_pyd_name(python的pyd文件实际也就是windows平台下动态链接库, ## 只不过扩展名不一样而已) ## native.genrule( name="gen_" + cc_library_pyd_name, srcs=[":" + cc_library_name], outs=[cc_library_pyd_name], cmd="cp $< $@",) ## ## py_library规则定义一个python库目标,如果是windows平台下 ## 则依赖.pyd文件cc_library_pyd_name,这会出发上面的拷贝动作,其他 ## 平台下,则依赖.so文件cc_library_name native.py_library( name=name, srcs=[":" + name + ".py"], srcs_version="PY2AND3", data=select({ clean_dep("//tensorflow:windows"): [":" + cc_library_pyd_name], "//conditions:default": [":" + cc_library_name], }))
最后,执行bazel build命令,在windows下,会生成下列文件:
pywrap_tensorflow_internal.ccpywrap_tensorflow_internal.py_pywrap_tensorflow_internal.pyd
而在非window平台下,则生成下列文件:
pywrap_tensorflow_internal.ccpywrap_tensorflow_internal.py_pywrap_tensorflow_internal.so
小结
总结一下,本章中,我们通过工具bazel query,找到了混合编程中链接两个世界的模块pywrap_tensorflow_internal,实际上它就是Python的一个扩展,python的代码通过这个扩展就可以调用底层的C/C++代码了。然后分析此工程的过程中,引入了SWIG工具,它使得C/C++代码很方便的导出到各种其他的脚本语言。
作者:Jony0917
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